Bidang I
Akademik dan Riset, Sumber Daya Manusia, dan Kerjasama
Kepala Biro Administrasi Akademik, Riset, SDM, dan Kerjasama.
H. Akhmad Hafidz, S.Ag
Bagian Akademik dan Riset
Bagian SDM dan Hukum
Bagian Kerjasama dan Hubungan Internasional
Kepala Lembaga Penelitian, Penerbitan dan Pengabdian Masyarakat
Ahmad Khoiri, M.Pd.
Kepala Lembaga Penjaminan Mutu
M. Ali Mustofa Kamal, AH., S.Th.I., M.S.I.
Kepala Lembaga Perencanaan dan Pengembangan Akademik
Dr. H. Noor Aziz, M.Pd.
Kepala Unit Pelaksana Teknis Perpustakaan
Dr. H. Machfudz, M.Ag.
Kepala Unit Pelaksana Teknis Bahasa
Chairani Astina, M.Pd.
Bidang II
Administrasi Umum dan Perencanaan, Keuangan dan Aset, Ke-Al-Qur'anan dan Ke-Aswajaan
Kepala Biro Administrasi Umum, Keuangan, Perencanaan dan Aset
Ahmad Hafizh, S.H.I.
Bagian Umum dan Humas
Bagian Perencanaan Keuangan dan Anggaran
Bagian Aset dan Rumah Tangga
Kepala Lembaga Tahfidz dan Pengkajian Al-Qur'an
Mukromin, Alh., M.Ag.
Kepala Lembaga Kajian Islam Nusantara dan Aswaja An-Nahdliyah
Samsul Munir, Drs. H., M.Ag.
Bidang III
Kemahasiswaan dan Alumni, Inovasi Teknologi, dan Penerimaan Mahasiswa Baru
Kepala Biro Administrasi Kemahasiswaan, Alumni, Inovasi Teknologi, dan PMB
Latu Menur Cahyadi, SE.
Bagian IT dan Sistem Informasi Mahasiswa
Bagian Kemahasiswaan dan Alumni
Bagian UNSIQ Carer Center
Kepala Unit Pelaksana Teknis Laboratorium
Dian Asmarajati, M.Kom.
Kepala Unit Pelaksana Sentra Kekayaan Intelektual dan Inovasi Teknologi
Sri Jumini, M.Pd.
Kepala Unit Pelaksana Teknis Penerimaan Mahasiswa Baru
Ali Muktafi, M.S.I.